華大基因研究人員發(fā)表東亞江豚的無間隙基因組組裝

2025-11-23 10:55:14 分類：休閑 閱讀(318)

基因功能注釋使用五個公共數(shù)據(jù)庫生成統(tǒng)計維恩圖：NR，InterPro，研究KEGG，發(fā)表麗江外圍（外圍預(yù)約）外圍聯(lián)系方式（微信180-4582-8235）1-2線城市同城快速安排，30分鐘準(zhǔn)時到達(dá)SwissProt和KOG。東亞的無（科學(xué)數(shù)據(jù)（2022 年）。組組裝DOI： 10.1038/s41597-022-01868-4）
（神秘的基因江豚間隙基因地球uux.cn）據(jù)美國物理學(xué)家組織網(wǎng)（作者：華大基因）：東亞江豚（Neophocaena asiaeorientalis sunameri）是一種小型淡水鯨類物種。該物種是研究一組小型齒鯨，主要分布在南亞和東亞。發(fā)表分布于西太平洋、東亞的無印度洋、組組裝日本海近海，基因江豚間隙基因在中國海域也出現(xiàn)在渤海、研究黃海、發(fā)表麗江外圍（外圍預(yù)約）外圍聯(lián)系方式（微信180-4582-8235）1-2線城市同城快速安排，30分鐘準(zhǔn)時到達(dá)東海、東亞的無南海和長江中下游。組組裝先前的研究發(fā)現(xiàn)，長江江豚（N. a. asiaeorientalis）和東亞有鰭江豚之間的遺傳分化達(dá)到了種間水平。
在這項發(fā)表在《科學(xué)數(shù)據(jù)》雜志上的研究中，華大基因的研究人員幫助東亞江豚生成了一個無間隙基因組組裝，為鯨目動物的比較基因組學(xué)和受威脅物種的保護(hù)生物學(xué)提供了新的資源。
無間隙基因組組裝意味著整個基因組被拼湊在一起，沒有任何間隙或缺失的部分。產(chǎn)生無間隙基因組組裝是一項重大成就，因為它可以更準(zhǔn)確地理解生物體的遺傳學(xué)，并且可以深入了解其進(jìn)化歷史。
研究人員成功地為江豚生成了一個無間隙的基因組組裝，這是一項重大成就。它的大小約為 2.5 Gb，超過其 21 條常染色體和兩條性染色體。總共預(yù)測了22，814個蛋白質(zhì)編碼基因，其中97.31%被功能注釋，這意味著95.3%的基因組已被拼湊成連續(xù)的拉伸，沒有任何間隙。
基因組組裝還有一個1.2 Mb的支架N50，這是基因組最大連續(xù)段大小的量度。較大的支架N50表示更高質(zhì)量的全基因組DNA序列重建。研究人員還在基因組組裝中發(fā)現(xiàn)了大量的蛋白質(zhì)編碼基因。
除了生成基因組組裝外，研究人員還進(jìn)行了各種分析，以調(diào)查江豚的進(jìn)化歷史和對其水生環(huán)境的適應(yīng)。他們發(fā)現(xiàn)這種可愛的鯨目動物具有遺傳適應(yīng)性，可能對其在淡水棲息地的生存很重要，包括參與滲透調(diào)節(jié)（調(diào)節(jié)體內(nèi)水和電解質(zhì)平衡）和解毒的基因。
研究人員還發(fā)現(xiàn)了許多與聽覺、嗅覺和免疫有關(guān)的基因，這些基因是江豚獨有的。
總體而言，這項研究代表了我們對東亞江豚及其遺傳學(xué)的理解向前邁出的重要一步。無間隙基因組組裝和獨特基因的鑒定可能會為未來對該物種及其進(jìn)化歷史的研究提供寶貴的資源。
在未來，這項研究可能有助于我們更好地了解和保護(hù)這種動物，它在其自然棲息地面臨眾多威脅。它還可能有助于與其他鯨目動物物種進(jìn)行比較研究，并了解整個鯨目動物的進(jìn)化歷史。